Курсовая работа для студентов 1-3 курсов по биоинформатике

Курсовая работа для студентов 1-3 курсов по биоинформатике Анализ трехмерных структур изоферментов простагландин H синтазы и оценка влияния точечных аминокислотных замен на структурные и функциональные особенности белка. Фермент простагландин H-синтаза (PGHS, К.Ф.1.14.99.1) осуществляет первый этап в биосинтезе всех простагландинов, а также тромбоксана и простациклина, катализируя превращение молекулы арахидоновой кислоты в простагландин . Простагландины - модуляторы сердечно-сосудистой, желудочно-кишечной, почечной и репродуктивной систем, они являются медиаторами боли, воспаления, повышения температуры, аллергии, и поэтому фермент, катализирующий их биосинтез, представляет собой исключительно важную фармакологическую мишень. Терапевтический эффект аспирина и других нестероидных противовоспалительных средств обусловлен ингибированием PGHS. PGHS является бифункциональным ферментом и катализирует 2 реакции - циклооксигеназное окисление арахидоновой кислоты двумя молекулами кислорода с образованием простагландина G2 и пероксидазное восстановление перекисной группы простагландина G2 в присутствии донора электронов с образованием простагландина H2. Обе реакции идут на одной молекуле белка на двух близко расположенных активных центрах. Обе реакции гемзависимы и сопровождаются необратимой инактивацией фермента в процессе реакции. Известна трехмерная структура изоферментов PGHS – PGHS1 и PGHS2, однако кардинальные вопросы функционирования фермента: взаимосвязь между циклооксигеназной и пероксидазной активностями, природа инактивации фермента в процессе реакции – остаются открытыми. Абсолютно нерешенный вопрос – каким путем в активный центр фермента проникают 2 молекулы кислорода, обеспечивая при этом высокую стереоспецифичность циклооксигеназного окисления арахидоновой кислоты. Планируется следующий план работы: - Теоретическое введение. Обзор литературы. Характеристика белка PGHS (биологическая роль, изоформы, особенности структуры, катализируемые реакции) анализ кристаллической структуры изоформ PGHS, строения активного центра и его белкового окружения анализ изменений в структуре и свойствах белка, вызванных известными мутациями PGHS1 и PGHS2 (по литературным данным) поиск позиций для новых мутаций, прогнозирование возможного эффекта этих мутаций обзор использованного в работе программного обеспечения, выработка критериев его соответствия поставленной задаче выводы Руководитель работы: Ассистент Андриенко Татьяна Николаевна, к. 612 Лабораторного корпуса Б, тел. 938-2323, mailto: tanandri@yahoo.com Супервайзер: профессор Вржещ Петр Владимирович, факультет биоинженерии и биоинформатики МГУ, к. 610 Лабораторного корпуса Б, тел. 938-2422, mailto: peter@genebee.msu.ru

Похожие:

	Курсовая работа для студентов 1-3 курсов по биоинформатике Механизм взаимодействия циклооксигеназного и пероксидазного активных центров фермента pghs. (на основании литературных данных и расчетов...		Курсовая работа по биоинформатике Тема : идентификация белка, исследование его аминокислотной последовательности и построение филогенетического древа гомологов
	Курсовая работа по биоинформатике ...		Методические рекомендации к организации самостоятельной работы по... Предназначены для студентов – заочников начального обучения педагогического факультета тгпи им. Д. И. Менделеева. Цель данных рекомендаций...
	Курсовая работа по биоинформатике на тему Поиск белков-мишеней циклопентеноновых простагландинов При сравнении лиганд-связывающих участков ppar выделены специфические последовательности. Поиск гомологов привел к описанию нескольких...		Темы контрольных работ по физической культуре для студентов заочного... Летние Олимпийские игры, Олимпийское движение и его значение (участие Российских спортсменов)
	Методические рекомендации по выполнению курсовой работы для студентов... Информация для студентов курсовая работа принимается на проверку только при наличие заполненной заявки		Курсовая работа по истории государства и права Государственный строй и право Новгорода и Пскова в XII-XV вв.: курсовая работа. — Ульяновск: Уфмгу, 1995. — 55 с
	Курсовая работа на тему: «Особенности самоотношения у студентов из неполных семей» Во втором разделе представлено экспериментальное исследование изучения самоотношения у студентов из неполных семей		«Городской центр детского (юношеского) технического творчества» (ул.... Приглашает на работу студентов старших курсов, аспирантов, преподавателей на должность педагога дополнительного образования по направлению...