2. Обзор литературы Апоптоз




Скачать 253.1 Kb.
Название2. Обзор литературы Апоптоз
страница1/6
Дата публикации05.03.2013
Размер253.1 Kb.
ТипАнализ
litcey.ru > Информатика > Анализ
  1   2   3   4   5   6


Московский государственный университет

Поиск белков, с одночастичным сигналом ядерной локализации, расщепляемых каспазами при апоптозе.
Галимов Евгений Рафаэлевич

студент 2-ого курса факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ

Научный руководитель: аспирант первого года

обучения Химического факультета МГУ Филонов Г.С.

Оглавление

1. Введение 3

2. Обзор литературы 4

2.1. Апоптоз 4

2.2. Каспазы 5

2.3. Сигналы ядерной локализации (NLS, nuclear localization signal) 9

3. Результаты и обсуждение 11

Анализ гомологов 12

Анализ третичной структуры 16

4. Экспериментальная часть 19

5. Выводы 20

i.6. Список литературы 21



1. Введение


Стремительное развитие компьютерных баз данных, содержащих информацию о белках и геномах, а также биоинформатических методов анализа и поиска по этим базам позволяет успешно решать различные биологические задачи не прибегая к эксперименту. К примеру, в появившейся недавно работе исключительно биоинформатическими методами были полностью реконструированы и описаны пути биосинтеза рибофлавина, биотина, тиамина и кобаламина, а также системы их регуляции у большого числа микроорганизмов [1].

Данная работа посвящена поиску биоинформатическими методами субстратов каспаз 2, 3, 7 (ключевых ферментов апоптоза). Поиск осуществлен с помощью модельной последовательности, отвечающей месту расщепления белка каспазами и находящейся вблизи него специфической последовательности положительно заряженных аминокислотных остатков, соответствующей классическому одночастичному сигналу ядерной локализации.
^

2. Обзор литературы

2.1. Апоптоз


У многоклеточных организмов – животных, растений и грибов – генетически заложена программа гибели клеток. Формообразовательные процессы в онтогенезе, позитивная и негативная селекция Т- и В-лимфоцитов, гиперчувствительный ответ растений на вторжение патогена, осенний листопад – лишь несколько примеров программируемой клеточной смерти [2]. Эволюционно программируемая клеточная смерть (апоптоз) возникла у прокариот как механизм противовирусной защиты популяций и был закреплен у одноклеточных эукариот. В дальнейшем, с появлением многоклеточных организмов, механизм совершенствовался и был приспособлен, наряду с защитой от патогенов, для реализации важных жизненных функций - дифференцировки клеток и тканей при эмбриогенезе и постэмбриональном развитии, элиминирования клеток иммунной системы, невостребованных, состарившихся клеток либо клеток, подвергшихся воздействию мутагенных факторов. Апоптоз у животных и человека стал неотъемлемым инструментом для осуществления наследственного и приобретенного, гуморального и клеточного ответа иммунной системы [4].

В клетке существуют системы запускающие и предотвращающие апоптоз. Они находятся в постоянном противодействии и стимулируются соответствующими факторами-индукторами и факторами-ингибиторами апоптоза.

Среди стимулов, запускающих апоптоз можно выделить неспецифические факторы, такие как температура, токсические агенты, оксиданты, свободные радикалы, γ- и УФ-излучение, вирусные инфекции, бактериальные токсины и др. и специфические факторы, определяющие апоптоз как физиологическое явление. Специфические факторы можно в свою очередь разделить на внутриклеточные сигналы, являющиеся следствием нарушений процессов жизнедеятельности в клетке, и внешние сигналы, опосредующие свое действие через рецепторные системы – различные гормоны, белки-антагонисты Bax (индуктор) и Bcl-2 (ингибитор), цитокины, семейство фактора некроза опухоли [3].

Морфологически апоптоз выглядит следующим образом:

Хроматин, который в норме представлен открытыми и конденсированными областями (гетеро- и эухроматин), становится сверхконденсированным в форме полумесяца по периферии ядра. Видны разрывы нитей ядерной ДНК. Сама клетка сморщивается, теряя до 1/3 своего объема за несколько минут. При этом целостность мембран сохраняется. Затем следует специфическая фрагментация ДНК, распад ядра на части, фрагментация клетки на мембранные везикулы с внутриклеточным содержимым (апоптотические тельца), фагоцитируемые макрофагами и соседними клетками [2-3].
  1   2   3   4   5   6

Похожие:

2. Обзор литературы Апоптоз icon2. Обзор литературы Апоптоз
Поиск белков, с одночастичным сигналом ядерной локализации, расщепляемых каспазами при апоптозе
2. Обзор литературы Апоптоз iconRu Соглашение об использовании
...
2. Обзор литературы Апоптоз icon«Лизинг. Арендные отношения. Особенности учета.»
Обзор изменений законодательства с 01. 01. 2013 г., обзор поправок в Гражданский кодекс рф, Налоговый кодекс рф, Трудовой кодекс...
2. Обзор литературы Апоптоз iconОтветы на вопросы. Комментарий
Обзор изменений законодательства, писем Минфина, фнс, Минздравсоцразвития. Обзор последней Арбитражной практики
2. Обзор литературы Апоптоз icon«Учетная политика: версия 2012 г.»
Обзор изменений законодательства, писем Минфина, фнс, Минздравсоцразвития. Обзор последней Арбитражной практики
2. Обзор литературы Апоптоз iconСложные вопросы исчисления и уплаты
Обзор последних изменений законодательства. Комментарии фнс и Минфина, Минздравсоцразвития. Обзор Арбитражной практики
2. Обзор литературы Апоптоз icon«денежные средства»
...
2. Обзор литературы Апоптоз icon24 мая 2012г. Приглашаем на семинар «Командировки. Отпуска. Пособия»
Обзор изменений законодательства, писем Минфина, фнс, Минздравсоцразвития. Обзор последней Арбитражной практики
2. Обзор литературы Апоптоз iconОбзор изменений
Обзор изменений Федерального закона от 24. 07. 2007 n 221-фз "О государственном кадастре недвижимости"
2. Обзор литературы Апоптоз icon12 апреля 2012г
Обзор последних изменений законодательства. Комментарии фнс и Минфина – анализ спорных вопросов. Обзор последней арбитражной практики...
Вы можете разместить ссылку на наш сайт:
Школьные материалы


При копировании материала укажите ссылку © 2013
контакты
litcey.ru
Главная страница