2. Обзор литературы Апоптоз
Скачать 252.26 Kb.
|
Московский государственный университет Поиск белков, с одночастичным сигналом ядерной локализации, расщепляемых каспазами при апоптозе. Галимов Евгений Рафаэлевичстудент 2-ого курса факультета биоинженерии и биоинформатики МГУ Научный руководитель: аспирант первого года обучения Химического факультета МГУ Филонов Г.С. Оглавление 1. Введение 3 2. Обзор литературы 4 2.1. Апоптоз 4 2.2. Каспазы 5 2.3. Сигналы ядерной локализации (NLS, nuclear localization signal) 9 3. Результаты и обсуждение 11 Анализ гомологов 12 Анализ третичной структуры 16 4. Экспериментальная часть 19 5. Выводы 20 i.6. Список литературы 21 1. ВведениеСтремительное развитие компьютерных баз данных, содержащих информацию о белках и геномах, а также биоинформатических методов анализа и поиска по этим базам позволяет успешно решать различные биологические задачи не прибегая к эксперименту. К примеру, в появившейся недавно работе исключительно биоинформатическими методами были полностью реконструированы и описаны пути биосинтеза рибофлавина, биотина, тиамина и кобаламина, а также системы их регуляции у большого числа микроорганизмов [1]. Данная работа посвящена поиску биоинформатическими методами субстратов каспаз 2, 3, 7 (ключевых ферментов апоптоза). Поиск осуществлен с помощью модельной последовательности, отвечающей месту расщепления белка каспазами и находящейся вблизи него специфической последовательности положительно заряженных аминокислотных остатков, соответствующей классическому одночастичному сигналу ядерной локализации. ^ У многоклеточных организмов – животных, растений и грибов – генетически заложена программа гибели клеток. Формообразовательные процессы в онтогенезе, позитивная и негативная селекция Т- и В-лимфоцитов, гиперчувствительный ответ растений на вторжение патогена, осенний листопад – лишь несколько примеров программируемой клеточной смерти [2]. Эволюционно программируемая клеточная смерть (апоптоз) возникла у прокариот как механизм противовирусной защиты популяций и был закреплен у одноклеточных эукариот. В дальнейшем, с появлением многоклеточных организмов, механизм совершенствовался и был приспособлен, наряду с защитой от патогенов, для реализации важных жизненных функций - дифференцировки клеток и тканей при эмбриогенезе и постэмбриональном развитии, элиминирования клеток иммунной системы, невостребованных, состарившихся клеток либо клеток, подвергшихся воздействию мутагенных факторов. Апоптоз у животных и человека стал неотъемлемым инструментом для осуществления наследственного и приобретенного, гуморального и клеточного ответа иммунной системы [4]. В клетке существуют системы запускающие и предотвращающие апоптоз. Они находятся в постоянном противодействии и стимулируются соответствующими факторами-индукторами и факторами-ингибиторами апоптоза. Среди стимулов, запускающих апоптоз можно выделить неспецифические факторы, такие как температура, токсические агенты, оксиданты, свободные радикалы, γ- и УФ-излучение, вирусные инфекции, бактериальные токсины и др. и специфические факторы, определяющие апоптоз как физиологическое явление. Специфические факторы можно в свою очередь разделить на внутриклеточные сигналы, являющиеся следствием нарушений процессов жизнедеятельности в клетке, и внешние сигналы, опосредующие свое действие через рецепторные системы – различные гормоны, белки-антагонисты Bax (индуктор) и Bcl-2 (ингибитор), цитокины, семейство фактора некроза опухоли [3]. Морфологически апоптоз выглядит следующим образом: Хроматин, который в норме представлен открытыми и конденсированными областями (гетеро- и эухроматин), становится сверхконденсированным в форме полумесяца по периферии ядра. Видны разрывы нитей ядерной ДНК. Сама клетка сморщивается, теряя до 1/3 своего объема за несколько минут. При этом целостность мембран сохраняется. Затем следует специфическая фрагментация ДНК, распад ядра на части, фрагментация клетки на мембранные везикулы с внутриклеточным содержимым (апоптотические тельца), фагоцитируемые макрофагами и соседними клетками [2-3]. |
Похожие:
 | 2. Обзор литературы Апоптоз Поиск белков, с одночастичным сигналом ядерной локализации, расщепляемых каспазами при апоптозе |  | Ru Соглашение об использовании ... |
| «Лизинг. Арендные отношения. Особенности учета.» Обзор изменений законодательства с 01. 01. 2013 г., обзор поправок в Гражданский кодекс рф, Налоговый кодекс рф, Трудовой кодекс... | | Ответы на вопросы. Комментарий Обзор изменений законодательства, писем Минфина, фнс, Минздравсоцразвития. Обзор последней Арбитражной практики |
| «Учетная политика: версия 2012 г.» Обзор изменений законодательства, писем Минфина, фнс, Минздравсоцразвития. Обзор последней Арбитражной практики | | Сложные вопросы исчисления и уплаты Обзор последних изменений законодательства. Комментарии фнс и Минфина, Минздравсоцразвития. Обзор Арбитражной практики |
| «денежные средства» ... | | 24 мая 2012г. Приглашаем на семинар «Командировки. Отпуска. Пособия» Обзор изменений законодательства, писем Минфина, фнс, Минздравсоцразвития. Обзор последней Арбитражной практики |
| Обзор изменений Обзор изменений Федерального закона от 24. 07. 2007 n 221-фз "О государственном кадастре недвижимости" | | 12 апреля 2012г Обзор последних изменений законодательства. Комментарии фнс и Минфина – анализ спорных вопросов. Обзор последней арбитражной практики... |